Biết rõ thông tin thời tiết là yếu tố quan trọng để có một kỳ nghỉ sang trọng tuyệt vời tại Pekalongan. Tháng Mười và Tháng Năm thường là tháng nóng nhất với nhiệt độ trung bình 28°C; trong khi đó Tháng Tám và Tháng Bảy là tháng lạnh nhất với nhiệt độ trung bình 27°C. Tháng nhiều mưa nhất tại Pekalongan và Tháng Hai, Tháng Một, Tháng Mười Hai và Tháng Ba, với lượng mưa trung bình đến 453 mm mỗi tháng.