Biết rõ thông tin thời tiết rất quan trọng khi lên kế hoạch cho kỳ nghỉ sang chảnh tại Yakushima. Tháng Tám và Tháng Bảy thường là tháng nóng nhất với nhiệt độ trung bình 27°C; trong khi đó Tháng Một và Tháng Hai là tháng lạnh nhất với nhiệt độ trung bình 15°C. Th áng nhiều mưa nhất tại Yakushima và Tháng Sáu, Tháng Chín, Tháng Năm và Tháng Bảy, với lượng mưa trung bình đến 364 mm mỗi tháng.